Psychedelia.dk

Hvordan ser man på et molekyle om det kan binde sig til serotonin receptoren?

Hvis man ser på serotonin, mdma, meskalin og Psilocin så ligner de da ikke meget serotonin?

Serotonin


MDMA


Meskalin




Psilocin




Hvis man ser på dopamin:

Dopamin


Amfetamin

Det er en enormt kompleks sag at afgøre hvorvidt et molekyle passer i en given receptor. Hverken serotonin- eller dopaminreceptorens struktur er kendt, så det bedste man kan gøre er at tage udgangspunkt i nogen fællestræk for molekyler man ved binder til den. Det kunne være methylendioxy-gruppen og så aminen på sidekæden for serotoninreceptoren. Hvis et molekyle har disse to grupper de rigtige steder er der god chance for at de har en aktivitet. Men uden at have strukturen for det aktive site er det svært at designe et molekyle man ved vil passe ind, uden en del gætværk (selv hvis man kender strukturen er der stadig meget gætteri involveret).

Aha, jamen det gjorde mig da lidt klogere på det område, mange tak (:

Hvordan kan det være at man ikke kender receptorernes strukturer? Er der ikke nogen der har prøvet at dissekere en hjerne og kigge på dem under mikroskop? Eller er det ikke så simpelt bare lige at gøre?

Selvom man godt kan se meget store proteinstrukturer med et elektronmikroskop, så kan man på ingen måde se et proteins tertiære struktur. For at udlede den skal man bruge NMR eller røntgen krystallografi, og særligt sidstnævnte er hjernedødt besværlig, og metodologien er ret tilfældig. Og især membranproteiner er dumme at have med at gøre.

Se mere her.